Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 826 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
HIF1AQ16665 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139 ms