Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
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DDB1Q16531 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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DDB1Q16531 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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DDB1Q16531 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
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DDB1Q16531 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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DDB1Q16531 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
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DDB1Q16531 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
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DDB1Q16531 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
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DDB1Q16531 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
DDB1Q16531 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
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