Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.9 ms