Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC0.82□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC0.82□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC0.82□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC0.82□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC0.82□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC0.81□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC0.81□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC0.81□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC0.81□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC0.81□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC0.81□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AC104350.1-201ENST00000518750 877 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC0.8□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 SETP10-201ENST00000424368 814 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AC145141.1-201ENST00000510180 567 ntTSL 4 BASIC0.8□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC0.8□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AC016590.3-201ENST00000611171 753 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC0.8□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC0.8□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
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