Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC1.22□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC1.22□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC1.22□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC1.21□□□□□ -2.21
HMGN3Q15651 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.21□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AC084033.1-201ENST00000550830 633 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HMGN3Q15651 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.4 ms