Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SHHQ15465 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SHHQ15465 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SHHQ15465 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SHHQ15465 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SHHQ15465 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SHHQ15465 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SHHQ15465 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SHHQ15465 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SHHQ15465 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SHHQ15465 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SHHQ15465 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SHHQ15465 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SHHQ15465 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SHHQ15465 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SHHQ15465 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SHHQ15465 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SHHQ15465 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SHHQ15465 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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SHHQ15465 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SHHQ15465 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SHHQ15465 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SHHQ15465 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SHHQ15465 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SHHQ15465 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
SHHQ15465 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SHHQ15465 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SHHQ15465 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SHHQ15465 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.59□□□□□ -2
SHHQ15465 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
SHHQ15465 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
SHHQ15465 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
SHHQ15465 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SHHQ15465 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SHHQ15465 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SHHQ15465 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SHHQ15465 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SHHQ15465 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SHHQ15465 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SHHQ15465 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SHHQ15465 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SHHQ15465 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SHHQ15465 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SHHQ15465 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
SHHQ15465 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SHHQ15465 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SHHQ15465 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SHHQ15465 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SHHQ15465 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SHHQ15465 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SHHQ15465 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SHHQ15465 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SHHQ15465 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SHHQ15465 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SHHQ15465 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SHHQ15465 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
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SHHQ15465 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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SHHQ15465 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SHHQ15465 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SHHQ15465 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
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SHHQ15465 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
SHHQ15465 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
SHHQ15465 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
SHHQ15465 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SHHQ15465 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SHHQ15465 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SHHQ15465 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SHHQ15465 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SHHQ15465 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
SHHQ15465 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SHHQ15465 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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SHHQ15465 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SHHQ15465 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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