Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SHPRHQ149N8 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
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