Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC4.43□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RRP1BQ14684 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.5 ms