Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.14
COL4A6Q14031 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
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COL4A6Q14031 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 AC244033.1-201ENST00000426826 870 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
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COL4A6Q14031 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC1.63□□□□□ -2.15
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COL4A6Q14031 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC1.62□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC1.62□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
COL4A6Q14031 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
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