Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.47□□□□□ -2.17
PDE6HQ13956 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
PDE6HQ13956 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PDE6HQ13956 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PDE6HQ13956 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PDE6HQ13956 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC1.47□□□□□ -2.17
PDE6HQ13956 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PDE6HQ13956 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PDE6HQ13956 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PDE6HQ13956 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PDE6HQ13956 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PDE6HQ13956 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PDE6HQ13956 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PDE6HQ13956 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
PDE6HQ13956 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PDE6HQ13956 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
PDE6HQ13956 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PDE6HQ13956 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PDE6HQ13956 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PDE6HQ13956 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC1.47□□□□□ -2.17
PDE6HQ13956 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PDE6HQ13956 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PDE6HQ13956 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
PDE6HQ13956 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PDE6HQ13956 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
PDE6HQ13956 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PDE6HQ13956 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
PDE6HQ13956 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PDE6HQ13956 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PDE6HQ13956 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PDE6HQ13956 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PDE6HQ13956 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PDE6HQ13956 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC1.47□□□□□ -2.17
PDE6HQ13956 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
PDE6HQ13956 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
PDE6HQ13956 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PDE6HQ13956 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PDE6HQ13956 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PDE6HQ13956 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
PDE6HQ13956 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PDE6HQ13956 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PDE6HQ13956 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
PDE6HQ13956 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC1.45□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC1.45□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
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