Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CCINQ13939 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CCINQ13939 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CCINQ13939 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CCINQ13939 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CCINQ13939 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CCINQ13939 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CCINQ13939 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CCINQ13939 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CCINQ13939 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CCINQ13939 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CCINQ13939 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CCINQ13939 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CCINQ13939 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CCINQ13939 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CCINQ13939 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CCINQ13939 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CCINQ13939 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CCINQ13939 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CCINQ13939 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CCINQ13939 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CCINQ13939 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CCINQ13939 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CCINQ13939 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CCINQ13939 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CCINQ13939 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CCINQ13939 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CCINQ13939 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CCINQ13939 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CCINQ13939 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CCINQ13939 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CCINQ13939 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CCINQ13939 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CCINQ13939 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CCINQ13939 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CCINQ13939 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CCINQ13939 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CCINQ13939 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CCINQ13939 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CCINQ13939 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CCINQ13939 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CCINQ13939 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CCINQ13939 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CCINQ13939 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CCINQ13939 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CCINQ13939 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CCINQ13939 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CCINQ13939 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CCINQ13939 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CCINQ13939 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CCINQ13939 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CCINQ13939 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCINQ13939 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCINQ13939 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCINQ13939 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCINQ13939 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCINQ13939 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CCINQ13939 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCINQ13939 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCINQ13939 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCINQ13939 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCINQ13939 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCINQ13939 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCINQ13939 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCINQ13939 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCINQ13939 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CCINQ13939 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCINQ13939 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCINQ13939 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCINQ13939 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CCINQ13939 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CCINQ13939 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCINQ13939 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCINQ13939 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCINQ13939 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCINQ13939 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCINQ13939 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCINQ13939 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCINQ13939 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCINQ13939 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCINQ13939 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCINQ13939 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CCINQ13939 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCINQ13939 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CCINQ13939 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCINQ13939 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCINQ13939 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCINQ13939 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCINQ13939 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCINQ13939 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCINQ13939 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCINQ13939 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCINQ13939 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCINQ13939 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCINQ13939 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCINQ13939 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CCINQ13939 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CCINQ13939 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CCINQ13939 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CCINQ13939 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.1 ms