Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

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Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC1.34□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 AC244033.1-201ENST00000426826 870 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
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