Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.61□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
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