Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC4□□□□□ -1.77
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TUBB3Q13509 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
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TUBB3Q13509 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
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TUBB3Q13509 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TUBB3Q13509 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
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