Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CLN3Q13286 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
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