Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRIM28Q13263 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
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