Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
NME3Q13232 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NME3Q13232 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
NME3Q13232 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NME3Q13232 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NME3Q13232 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NME3Q13232 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NME3Q13232 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NME3Q13232 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NME3Q13232 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NME3Q13232 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
NME3Q13232 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
NME3Q13232 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
NME3Q13232 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
NME3Q13232 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
NME3Q13232 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
NME3Q13232 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NME3Q13232 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NME3Q13232 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NME3Q13232 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NME3Q13232 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
NME3Q13232 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NME3Q13232 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NME3Q13232 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
NME3Q13232 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
NME3Q13232 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NME3Q13232 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NME3Q13232 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
NME3Q13232 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
NME3Q13232 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
NME3Q13232 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NME3Q13232 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NME3Q13232 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
NME3Q13232 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NME3Q13232 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
NME3Q13232 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NME3Q13232 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
NME3Q13232 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NME3Q13232 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NME3Q13232 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NME3Q13232 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NME3Q13232 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NME3Q13232 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NME3Q13232 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NME3Q13232 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NME3Q13232 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NME3Q13232 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NME3Q13232 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NME3Q13232 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NME3Q13232 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NME3Q13232 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NME3Q13232 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NME3Q13232 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NME3Q13232 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NME3Q13232 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
NME3Q13232 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NME3Q13232 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NME3Q13232 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NME3Q13232 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NME3Q13232 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NME3Q13232 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NME3Q13232 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms