Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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