Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.1 ms