Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
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GRIK3Q13003 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
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GRIK3Q13003 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
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GRIK3Q13003 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
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GRIK3Q13003 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
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