Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
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