Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
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PGGT1BP53609 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
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PGGT1BP53609 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
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PGGT1BP53609 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
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PGGT1BP53609 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
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PGGT1BP53609 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
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PGGT1BP53609 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
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PGGT1BP53609 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
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PGGT1BP53609 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
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