Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRMP28827 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
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PTPRMP28827 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
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PTPRMP28827 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
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PTPRMP28827 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
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PTPRMP28827 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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PTPRMP28827 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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PTPRMP28827 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPRMP28827 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
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