Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
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PTPRBP23467 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRBP23467 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
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PTPRBP23467 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 RNU6-883P-201ENST00000384597 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
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PTPRBP23467 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
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PTPRBP23467 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
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PTPRBP23467 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
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