Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104 ms