Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
BCANQ96GW7 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
BCANQ96GW7 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
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