Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHCHD4Q8N4Q1 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHCHD4Q8N4Q1 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHCHD4Q8N4Q1 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHCHD4Q8N4Q1 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHCHD4Q8N4Q1 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHCHD4Q8N4Q1 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHCHD4Q8N4Q1 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHCHD4Q8N4Q1 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHCHD4Q8N4Q1 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHCHD4Q8N4Q1 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHCHD4Q8N4Q1 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHCHD4Q8N4Q1 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHCHD4Q8N4Q1 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHCHD4Q8N4Q1 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHCHD4Q8N4Q1 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHCHD4Q8N4Q1 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHCHD4Q8N4Q1 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHCHD4Q8N4Q1 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHCHD4Q8N4Q1 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHCHD4Q8N4Q1 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHCHD4Q8N4Q1 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHCHD4Q8N4Q1 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHCHD4Q8N4Q1 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHCHD4Q8N4Q1 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CHCHD4Q8N4Q1 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CHCHD4Q8N4Q1 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHCHD4Q8N4Q1 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHCHD4Q8N4Q1 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHCHD4Q8N4Q1 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms