Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PHYHD1Q5SRE7 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PHYHD1Q5SRE7 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PHYHD1Q5SRE7 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PHYHD1Q5SRE7 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PHYHD1Q5SRE7 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PHYHD1Q5SRE7 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PHYHD1Q5SRE7 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PHYHD1Q5SRE7 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PHYHD1Q5SRE7 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PHYHD1Q5SRE7 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PHYHD1Q5SRE7 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PHYHD1Q5SRE7 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PHYHD1Q5SRE7 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PHYHD1Q5SRE7 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PHYHD1Q5SRE7 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PHYHD1Q5SRE7 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PHYHD1Q5SRE7 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PHYHD1Q5SRE7 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PHYHD1Q5SRE7 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PHYHD1Q5SRE7 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PHYHD1Q5SRE7 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PHYHD1Q5SRE7 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PHYHD1Q5SRE7 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PHYHD1Q5SRE7 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC2.59□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PHYHD1Q5SRE7 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.1 ms