Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
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GEN1Q17RS7 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
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