Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC2.05□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC2.04□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC2.04□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.03□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
IMPG1Q17R60 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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