Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RTN1Q16799 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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