Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CLPPQ16740 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
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