Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC0.86□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 LINC00446-201ENST00000414743 459 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC0.85□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC0.85□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC0.84□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HERC1Q15751 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AC016573.1-201ENST00000523205 539 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC0.84□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC0.84□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC0.84□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AL023584.2-201ENST00000454411 444 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AL161912.3-201ENST00000605404 628 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC0.83□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
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