Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NECTIN1Q15223 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NECTIN1Q15223 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NECTIN1Q15223 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NECTIN1Q15223 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
NECTIN1Q15223 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NECTIN1Q15223 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
NECTIN1Q15223 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NECTIN1Q15223 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NECTIN1Q15223 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NECTIN1Q15223 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NECTIN1Q15223 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NECTIN1Q15223 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NECTIN1Q15223 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NECTIN1Q15223 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NECTIN1Q15223 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NECTIN1Q15223 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NECTIN1Q15223 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NECTIN1Q15223 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NECTIN1Q15223 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NECTIN1Q15223 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NECTIN1Q15223 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NECTIN1Q15223 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
NECTIN1Q15223 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NECTIN1Q15223 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
NECTIN1Q15223 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NECTIN1Q15223 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NECTIN1Q15223 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NECTIN1Q15223 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NECTIN1Q15223 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NECTIN1Q15223 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NECTIN1Q15223 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NECTIN1Q15223 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NECTIN1Q15223 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NECTIN1Q15223 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NECTIN1Q15223 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NECTIN1Q15223 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
NECTIN1Q15223 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NECTIN1Q15223 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NECTIN1Q15223 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NECTIN1Q15223 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NECTIN1Q15223 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NECTIN1Q15223 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NECTIN1Q15223 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NECTIN1Q15223 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NECTIN1Q15223 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NECTIN1Q15223 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NECTIN1Q15223 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NECTIN1Q15223 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NECTIN1Q15223 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NECTIN1Q15223 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NECTIN1Q15223 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NECTIN1Q15223 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NECTIN1Q15223 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NECTIN1Q15223 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NECTIN1Q15223 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NECTIN1Q15223 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NECTIN1Q15223 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NECTIN1Q15223 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NECTIN1Q15223 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
NECTIN1Q15223 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NECTIN1Q15223 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NECTIN1Q15223 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NECTIN1Q15223 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NECTIN1Q15223 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NECTIN1Q15223 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NECTIN1Q15223 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NECTIN1Q15223 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NECTIN1Q15223 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NECTIN1Q15223 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NECTIN1Q15223 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NECTIN1Q15223 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NECTIN1Q15223 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NECTIN1Q15223 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NECTIN1Q15223 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
NECTIN1Q15223 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
NECTIN1Q15223 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NECTIN1Q15223 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NECTIN1Q15223 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NECTIN1Q15223 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NECTIN1Q15223 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NECTIN1Q15223 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
NECTIN1Q15223 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NECTIN1Q15223 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NECTIN1Q15223 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NECTIN1Q15223 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
NECTIN1Q15223 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NECTIN1Q15223 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NECTIN1Q15223 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NECTIN1Q15223 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NECTIN1Q15223 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NECTIN1Q15223 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NECTIN1Q15223 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NECTIN1Q15223 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NECTIN1Q15223 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NECTIN1Q15223 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NECTIN1Q15223 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NECTIN1Q15223 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NECTIN1Q15223 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NECTIN1Q15223 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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