Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 RNF19BPX-201ENST00000426224 625 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMCO1Q147U7 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
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