Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SEMA3AQ14563 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.4 ms