Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
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ERV3-1Q14264 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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ERV3-1Q14264 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
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ERV3-1Q14264 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ERV3-1Q14264 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
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