Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
COL9A3Q14050 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106 ms