Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 OR5H15-202ENST00000641450 1229 ntAPPRIS P1 BASIC1.37□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC1.36□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC1.36□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC1.36□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.34□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CACNA1CQ13936 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
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