Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC069306.1-201ENST00000507006 843 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
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DDX39BQ13838 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
DDX39BQ13838 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
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