Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 RWDD4P1-201ENST00000488019 565 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SPTAN1Q13813 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC1.09□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SPTAN1Q13813 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
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