Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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