Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ITGB3BPQ13352 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ITGB3BPQ13352 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ITGB3BPQ13352 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
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ITGB3BPQ13352 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
ITGB3BPQ13352 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
ITGB3BPQ13352 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
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ITGB3BPQ13352 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
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ITGB3BPQ13352 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
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ITGB3BPQ13352 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
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ITGB3BPQ13352 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
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ITGB3BPQ13352 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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ITGB3BPQ13352 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
ITGB3BPQ13352 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ITGB3BPQ13352 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ITGB3BPQ13352 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ITGB3BPQ13352 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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ITGB3BPQ13352 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ITGB3BPQ13352 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
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ITGB3BPQ13352 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
ITGB3BPQ13352 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ITGB3BPQ13352 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
ITGB3BPQ13352 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ITGB3BPQ13352 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
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ITGB3BPQ13352 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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ITGB3BPQ13352 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ITGB3BPQ13352 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ITGB3BPQ13352 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
ITGB3BPQ13352 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ITGB3BPQ13352 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ITGB3BPQ13352 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ITGB3BPQ13352 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ITGB3BPQ13352 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
ITGB3BPQ13352 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ITGB3BPQ13352 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ITGB3BPQ13352 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ITGB3BPQ13352 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ITGB3BPQ13352 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ITGB3BPQ13352 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ITGB3BPQ13352 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ITGB3BPQ13352 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ITGB3BPQ13352 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ITGB3BPQ13352 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ITGB3BPQ13352 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ITGB3BPQ13352 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ITGB3BPQ13352 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ITGB3BPQ13352 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
ITGB3BPQ13352 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ITGB3BPQ13352 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
ITGB3BPQ13352 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ITGB3BPQ13352 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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