Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RIGQ13278 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RIGQ13278 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RIGQ13278 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RIGQ13278 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RIGQ13278 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RIGQ13278 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RIGQ13278 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RIGQ13278 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RIGQ13278 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RIGQ13278 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RIGQ13278 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RIGQ13278 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RIGQ13278 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RIGQ13278 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
RIGQ13278 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RIGQ13278 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
RIGQ13278 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
RIGQ13278 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RIGQ13278 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RIGQ13278 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RIGQ13278 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
RIGQ13278 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
RIGQ13278 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
RIGQ13278 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
RIGQ13278 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RIGQ13278 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RIGQ13278 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RIGQ13278 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
RIGQ13278 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RIGQ13278 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RIGQ13278 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RIGQ13278 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RIGQ13278 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RIGQ13278 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RIGQ13278 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RIGQ13278 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RIGQ13278 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RIGQ13278 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RIGQ13278 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RIGQ13278 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RIGQ13278 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RIGQ13278 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RIGQ13278 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RIGQ13278 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RIGQ13278 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RIGQ13278 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RIGQ13278 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RIGQ13278 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RIGQ13278 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RIGQ13278 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RIGQ13278 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RIGQ13278 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RIGQ13278 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RIGQ13278 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RIGQ13278 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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RIGQ13278 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RIGQ13278 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RIGQ13278 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RIGQ13278 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RIGQ13278 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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RIGQ13278 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RIGQ13278 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RIGQ13278 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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RIGQ13278 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RIGQ13278 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RIGQ13278 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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RIGQ13278 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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RIGQ13278 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RIGQ13278 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RIGQ13278 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RIGQ13278 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RIGQ13278 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RIGQ13278 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RIGQ13278 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RIGQ13278 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RIGQ13278 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RIGQ13278 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RIGQ13278 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RIGQ13278 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
RIGQ13278 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
RIGQ13278 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
RIGQ13278 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
RIGQ13278 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
RIGQ13278 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
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