Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PRKAA1Q13131 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PRKAA1Q13131 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PRKAA1Q13131 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PRKAA1Q13131 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PRKAA1Q13131 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PRKAA1Q13131 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PRKAA1Q13131 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
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PRKAA1Q13131 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PRKAA1Q13131 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PRKAA1Q13131 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
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PRKAA1Q13131 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PRKAA1Q13131 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PRKAA1Q13131 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PRKAA1Q13131 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PRKAA1Q13131 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PRKAA1Q13131 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PRKAA1Q13131 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
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PRKAA1Q13131 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PRKAA1Q13131 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PRKAA1Q13131 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PRKAA1Q13131 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
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PRKAA1Q13131 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
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PRKAA1Q13131 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
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PRKAA1Q13131 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
PRKAA1Q13131 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PRKAA1Q13131 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
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PRKAA1Q13131 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
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