Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
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CHAF1BQ13112 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
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CHAF1BQ13112 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
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CHAF1BQ13112 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
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CHAF1BQ13112 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
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CHAF1BQ13112 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
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