Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 NAP1L4P3-201ENST00000432820 1147 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PRDM2Q13029 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 AC069277.1-205ENST00000432743 630 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PRDM2Q13029 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.1 ms