Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK3Q13003 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms