Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
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CNTN1Q12860 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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CNTN1Q12860 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CNTN1Q12860 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
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