Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RBBP4Q09028 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.4 ms